Evidence mapPaperPMID 40619984Full record

ArticleThe New phytologist2025

Functional study of Phaeodactylum tricornutum Seipin highlights specificities of lipid droplets biogenesis in diatoms.

Damien Le Moigne, Marta Carletti, Chems Amari, Rachel Bonnarde, Fabien Richard, Catherine Albrieux, Mégane Mahieu, Matteo Arrighi, Grégory Si-Larbi, Pierre-Henri Jouneau and 11 more

Abstract read
In one paragraph

Article in The New phytologist, 2025. The graph could read no effect estimate from its abstract, so it casts no vote on the map. Cited by 4 papers.

0numbers the graph read from it
0cells of the map it votes in
4citing papers in PubMed
field-weighted citation impact
1 · What the graph read from it

What it found

Each row is one number read from the abstract, on the scale the paper reported it, with its interval. Left of the dashed line favours the treatment, right favours the comparator. Under each row is the sentence it came from. New to these charts? A ten-minute tutorial.

The abstract states no effect estimate the extractor could read, or names no intervention and outcome on the map, so this paper lights no cell and moves no belief. It is still indexed, cited and linked below.

2 · The registry

The trial behind it

Trials whose registry record cites this paper, or whose number appears in the abstract. A trial that started after this paper was published is citing it as background, not reporting it.

Neither the registry nor the abstract names a trial number. If this is a trial report, that itself is worth knowing.

3 · Its place in the literature

Who cites it

4 citing papers in PubMed.

  1. Review
  2. Review
  3. Review
  4. Article
4 · The record

Corrections and comments

PubMed lists nothing against this paper. Absence here is not a guarantee, only a check that was made.

5 · Who and what money

Authors and funding

21 authors.

Damien Le Moigne *Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0003-7084-361X
Marta Carletti *Laboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0000-3016-9155
Chems AmariLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0007-6700-4734
Rachel BonnardeLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0005-1822-324X
Fabien RichardLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0004-3165-5429
Catherine AlbrieuxLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.
Mégane MahieuLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.
Matteo ArrighiLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0002-1354-5638
Grégory Si-LarbiLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0001-8464-920X
Pierre-Henri JouneauLaboratoire Modélisation et Exploration des Matériaux, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Université Grenoble Alpes, IRIG, CEA-Grenoble, 17 avenue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0003-0350-4901
Valérie GrosLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0004-1974-8139
Mathilde LouwagieLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.
Sylvaine RoyLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0009-0005-2225-6976
Yangmin GongKey Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences, Wuhan, 430062, China.ORCID https://orcid.org/0000-0002-4096-3640
Yufang PanKey Laboratory of Algal Biology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, 430072, China.ORCID https://orcid.org/0000-0003-0150-1264
Hanhua HuKey Laboratory of Algal Biology, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan, 430072, China.ORCID https://orcid.org/0000-0002-8485-7591
Olivier BastienLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0003-1804-0222
Juliette JouhetLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0002-4402-2194
Alberto AmatoLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0002-9126-5535
Eric MaréchalLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0002-0060-1696
Juliette SalvaingLaboratoire de Physiologie Cellulaire et Végétale, Commissariat à l'Energie Atomique et aux Energies Alternatives, Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement, Centre National de la Recherche Scientifique, Université Grenoble Alpes; IRIG, CEA-Grenoble, 17 rue des Martyrs, 38000, Grenoble, France.ORCID https://orcid.org/0000-0002-5249-2225

Funding

ChimeraX -- Next Generation Visualization and Analysis Software for Multiscale ModelingR01GM129325 · NIGMS · UNIVERSITY OF CALIFORNIA, SAN FRANCISCO · PI FERRIN, THOMAS E · 2018 to 2025
$5.2M
Agence Nationale de la Recherche ANR-10-INBS-05-02Agence Nationale de la Recherche ANR-15-IDEX-02Agence Nationale de la Recherche ANR-22-CE44-0036-02Agence Nationale de la Recherche EUR CBS ANR-17-EURE-0003Agence Nationale de la Recherche GRAL Labex ANR-10-LABEX-04Agence Nationale de la Recherche PEPR Algadvance A-22-PEBB-0002Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies AlternativesFonds européen de développement régional (FEDER)Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement S-PHAEONational Natural Science Foundation of China 41976119National Natural Science Foundation of China 91751117NIGMS NIH HHS R01 GM129325Région Auvergne-Rhône-Alpes
6 · The paper itself

Abstract

Diatoms are a major phylum of microalgae, playing crucial ecological roles. They derive from secondary endosymbiosis, leading to a complex intracellular architecture. Their ability to store oil in lipid droplets (LDs) upon unfavourable conditions has raised interest for applications, in particular biofuels, yet Lipid Droplet (LD) biogenesis mechanisms in these organisms remain poorly understood. Here, we functionally characterize the homolog of Seipin, a major actor of LD biogenesis, in Phaeodactylum tricornutum. We used an in silico approach to analyze the evolutionary origin of PtSeipin and its specific features. Then, we used a functional genetics approach with a combination of confocal and electronic microscopy and lipidomics to characterize the protein function. We provide evidence that Stramenopiles Seipins were inherited from the host during secondary endosymbiosis. The localization of PtSeipin highlights participation of the plastid's most external membrane in LD biogenesis. Finally, the knock-out (KO) of PtSeipin leads to a strong increase of triacylglycerol (TAG) accumulation, a feature that had not been observed in adipogenic or oleaginous cells and is greatly enhanced following high light exposure. Our results suggest a redirection of lipid fluxes toward TAG synthesis, reduced TAG recycling or a combination of both in PtSeipin KO.

Indexed as

DiatomsLipid DropletsAmino Acid SequenceGene Knockout TechniquesLipidomicsPhylogenyPlastidsTriglyceridesTriglycerideslipid droplets biogenesislipidomicsPhaeodactylum tricornutumseipintriacylglycerol (TAG)

Identifiers

PMID40619984
PMCPMC12329175

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